课题经费选不征税收入一定划算吗？
不一定。不征税收入对应支出不得税前扣除——经费主要形成费用化支出且企业利润较高的，选征税收入可能总体更优。定性要在到账时算总账，选完不能改。
用课题经费发生的研发支出能加计扣除吗？
按不征税收入处理的经费，其支出形成的研发费用不得计入加计扣除基数；且高企口径研发费归集同样剔除。辅助账必须能按资金来源切分。
课题经费和公司自有研发费怎么分开？
每个课题设独立辅助核算项目，支出按预算科目归集、凭证标注课题编号，与自有资金的研发辅助账科目级分开——验收审计与加计扣除各自取数。
课题没做完、经费有结余怎么办？
按课题任务书与资金管理办法处理：留用、退回或结转均有明确规定，擅自处理结余是验收审计的否决项。结余处理方案在验收前与主管部门确认。
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