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ASO反义寡核苷酸修饰合成与功能验证研究报告

   日期:2026-03-07 20:46:18     来源:网络整理    作者:本站编辑    评论:0    
ASO反义寡核苷酸修饰合成与功能验证研究报告
公司介绍

武汉研锦生物(YanGeneBio)是一家专注于药物靶点发现与药物机制验证的创新型生物技术服务公司,为新药研发、中药现代化及天然产物研究提供从靶点发现到机制验证的一站式解决方案。

我们整合ABPPTPPLip-MS等药物钓靶技术,交联质谱、Lip-MS+分子对接鉴定药靶互作位点技术,SPR/MST/BLI/ITC/DSF检测药靶亲和力平台,蛋白芯片、Olink 多因子等高通量筛选检测平台,小核酸药物合成与类器官筛药等核心技术,为客户提供高精度的化合物靶点鉴定、结合位点分析、亲和力验证及功能验证服务

研锦生物以 “精准靶点、加速创新” 为使命,凭借严格的实验设计、高质量的数据输出和快速的项目交付,助力全球科研与药企客户缩短研发周期、提升药物发现成功率。

一.

技术原理

1. ASO作用机制

反义寡核苷酸(ASO)是15–22 nt单链核酸,通过碱基互补配对靶向结合mRNA,实现精准基因调控。

RNase H介导降解ASO与靶RNA形成DNA/RNA异源双链,激活RNase H1特异性切割RNA,实现基因沉默。

空间位阻调控:阻断核糖体结合或pre-mRNA剪接,调控蛋白表达与剪接亚型。

2. 核心化学修饰体系

硫代磷酸酯骨架(PS:提升核酸酶抗性、血清稳定性与细胞摄取,半衰期延长5–10倍。

2’-O-Me / 2’-MOE / LNA:增强结合亲和力(Tm提升3–8℃/修饰),降低脱靶与免疫原性。

Gapmer结构:两翼修饰+中间DNA窗口,兼顾稳定性与RNase H激活能力,为临床主流构型。

3. 合成原理

采用固相亚磷酰胺化学,以CPG为载体,循环完成脱保护-偶联-氧化/硫代-封端,实现单碱基精准合成与全程修饰。

二.

标准实验流程

1.序列设计与修饰方案

靶标序列验证;GC 40%–60%BLAST去同源;设计Gapmer;确定PS+2’-MOE/LNA修饰。

2.高通量固相合成

固相载体上循环合成;硫代反应构建PS骨架;单步偶联效率≥99.5%

3.切割与脱保护

氨水裂解切落;高温脱保护;获得ASO粗品。

4.纯化与质控

IP-RP-HPLC/IE-HPLC纯化;除短链、错配、氧化杂质。

质控:LC-MS确证分子量;HPLC测纯度;紫外定量;无酶水除盐。

5.体外功能验证

细胞转染;qPCRmRNA敲低;Western blot测蛋白;CCK-8测毒性;RNA-seq评估脱靶。

三.

结果与数据分析(对照数据)

以靶向Malat1Gapmer ASOPS+2’-MOE18 nt)为例:

合成偶联效率99.6%;粗品纯度83%;纯化后**≥97.5%**

分子量:实测与理论偏差<±1 Da,结构正确。

稳定性:血清中48 h残留≥70%;未修饰ASO 12 h完全降解。

结合亲和力Kd=2.8±0.5 nM;未修饰ASO Kd=42±6 nM,提升15

沉默效率5 nM浓度下,mRNA敲低82%,蛋白水平下降76%;未修饰仅29%

脱靶率:修饰ASO脱靶转录本<0.02%;未修饰组1.2%

结论:化学修饰显著提升ASO稳定性、亲和力、敲低效率与特异性,为体内外应用提供可靠保障。

四.

核心技术优势

6.修饰优势

核酸酶抗性提升、结合亲和力增强、脱靶与免疫原性降低、细胞摄取与组织分布优化。

7.合成优势

单步偶联高效、全流程可控、支持多修饰并行、纯化工艺成熟、纯度稳定达标。

8.应用优势

序列可编程、靶点覆盖广、无需病毒载体、可跨胞核/胞质作用、适合罕见病与慢病研发。

五.

应用案例

案例:SMA治疗ASO(诺西那生)

修饰:PS骨架+2’-MOEGapmer结构。

机制:促进SMN2 exon 7 inclusion,恢复功能性SMN蛋白。

关键数据:纯化纯度97.2%,血清半衰期>72 h,临床显著改善运动功能。

意义:证明修饰合成+结构设计可实现RNA剪接调控,为中枢神经系统疾病提供范式。

案例:肝靶向ASOGalNAc偶联)

修饰:PS+2’-MOE+GalNAc

优势:去唾液酸糖蛋白受体靶向,肝富集提升50,剂量降低90%

应用:代谢病、乙肝、NASH等基因治疗。

六.

服务覆盖实验场景

ASO序列设计与修饰方案(GapmerMixmer、剪接调控型)。

定制修饰合成:PS2’-O-Me2’-MOELNA5-Me-C、荧光/胆固醇/GalNAc标记。

纯化质控:HPLCLC-MS、定量、内毒素检测、冻干分装。

功能验证:qPCRWestern blotRNA剪接分析、MST亲和力、细胞/动物水平药效。

小核酸药物CMC开发:工艺优化、稳定性、方法学验证。

七.

总结

ASO核酸修饰合成是小核酸药物研发的核心支撑技术。通过硫代骨架+2’修饰+Gapmer结构协同优化,显著提升稳定性、亲和力与特异性;依托固相合成+高效纯化+严格质控体系,可稳定交付科研级/准临床级ASO。结合qPCRWestern blotMSTRNA-seq等功能验证,形成设计-合成-修饰-纯化-质控-功能一站式解决方案,为基因功能研究、靶点验证、罕见病与慢性病药物研发提供高效可靠工具,助力高分文章与新药转化。

 联系我们 
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邮件:15337192895@163.com
电话 | 微信:15337192895 (张老师)

Yangenebio对于中药及小分子药物研究,建立了一套完整的技术服务体系:

武汉研锦生物科技有限公司(YanGeneBio)提供产品:

1,天然产物、中药、代谢物等化合物靶点发现及SPR亲和力验证解决方案:

1)中药/复方的有效成分高精度鉴定,网络药理学分析及SPR验证互作;

2)化合物钓靶(标记法):ABPP钓靶(特异性强,重复性高,细胞水平钓靶);

3)化合物钓靶(非标记法):Lip-MS/CETSA(细胞、组织裂解液水平钓靶);

4)生物素标记法Spider药物钓靶(细胞、组织裂解液水平钓靶)

5)SPR/MST/BLI/ITC/DSF等策略检测分子间亲和力;

6)药﹣靶结合位点分析(Lip-MS+分子对接鉴定纯蛋白与化合物互作位点);

7)蛋白-蛋白结合位点分析(交联质谱+分子对接鉴定2个纯蛋白间互作位点);

8)ABPP-WB/CETSA-WB 在细胞水平鉴定药物与靶点蛋白互作分析;

9)提供真核、原核蛋白表达纯化服务;

10)提供定制化基因敲除细胞模型验证药物活性;

11)基于分子对接等策略提供化合物高通量虚拟筛选技术服务;

12)提供蛋白、抗体芯片筛选服务:磷酸化抗体芯片,炎症因子蛋白芯片等检测服务;

13)提供Olink多因子蛋白组学检测服务。

14)ASO等核酸修饰合成,siRNA核酸合成,类器官筛药服务。

2,提供重组活性细胞因子产品:应用类器官培养、完全培养基添加剂、干细胞培养、细胞治疗等领域。

3,提供分子互作仪、细胞电转仪、蛋白纯化仪、核酸合成仪及纯化仪等设备。

 
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