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AI新药研发的分化和行业趋势

   日期:2026-02-24 19:36:35     来源:网络整理    作者:本站编辑    评论:0    
AI新药研发的分化和行业趋势
AI制药行业悄悄经历了一波分化。
一边是“老面孔”的集体低迷。Recursion与Exscientia被迫合并,Schrödinger股价一年内下跌46%,Absci因TL1A项目数据不佳遭遇摩根士丹利下调评级。另一边却是“新贵”的强势崛起。Chai Discovery完成1.3亿美元B轮融资,Isomorphic Labs推出超越AlphaFold3的药物设计引擎,Xaira Therapeutics更以超10亿美元的初始融资震惊业界。
这种局面绝非偶然的资本轮动,而是行业底层逻辑深刻变革的外显。AI制药的底层逻辑正在发生怎样的剧变?

一、第一批AIDD公司为何陷入泥潭?

临床验证的缺失:当AI遇上生物学的复杂性。老一代公司的根本困境在于,平台效率的提升未能转化为更高的临床成功率。
早期的CADD 主要依赖物理规则模拟分子对接(如 Schrodinger)。随着深度学习的兴起,第一波 AI 制药公司(如 Atomwise)试图完全通过干实验室(Dry Lab)预测药物活性。然而,这一模式遭遇了生物学复杂性的挑战——单纯的算法无法模拟人体内复杂的生物通路。
Recursion与Exscientia合并后,管理层宣称实现了“60%的人时间缩减”和“40%更少毒性化合物”的过程指标。但问题在于,这些是“效率指标”,而非“疗效指标”。当REC-994和REC-2282因疗效不足而终止开发时,市场清醒地认识到:更快的失败仍然是失败。
Recursion 代表了第二代 AI 制药公司,即“TechBio”,核心理念是AI 的瓶颈不在于算法,而在于数据。因此,Recursion 并不从公共数据库抓取数据,而是建立了大规模的自动化湿实验室(Wet Lab),每周进行数百万次实验,生成 petabytes 级别的专有生物图像数据。这种“数据工厂”模式旨在构建生物学的“谷歌地图”。
此次并购前,Recursion 面临一个严峻的科学难题:Recursion OS 极其擅长通过表型筛选发现新的生物学靶点(Target Discovery),即它能告诉科学家“如果我们抑制基因 X,就能逆转疾病表型”。然而,Recursion 在制造能抑制基因 X 的分子方面能力较弱。这导致其早期管线多依赖于“老药新用”或外部引进。
Exscientia 的加入带来了自动化化学合成和AI 药物设计能力。Exscientia 的平台可以在高效地设计出具有特定属性(如高选择性、特定半衰期)的新分子实体(NCE)。
但投资人依然保持了谨慎态度。要理解这种谨慎,必须复盘REC-994 的失败。REC-994 (海绵状血管瘤 CCM)是 Recursion 成立初期的旗舰项目。虽然 2024 年 9 月宣布达到了安全性主要终点,但在 2025 年公布的长期扩展研究中,MRI 显示的病灶体积缩小和功能改善(mRS 评分)与自然病程(Natural History)无法区分。也就是说,药物是安全的,但没效。
REC-994 本质上是一种抗氧化剂(Tempol,超氧化物清除剂),并非 Recursion OS 从头设计的分子,而是通过表型筛选重新定位的老分子。它的失败揭示了单纯依赖表型筛选寻找老药新用的局限性——即使在细胞层面有效,在人体复杂的药代动力学环境下也可能失效。这也是公司为何必须收购 Exscientia 转向“精准设计”的根本原因。
同样,针对神经纤维瘤病的REC-2282 二期试验因无效而终止。这进一步加速了公司剥离旧资产、聚焦新资产的战略决心。
保留的核心资产有REC-617 (CDK7)抑制剂,适应症晚期实体瘤(卵巢癌、结直肠癌、肺癌);及REC-4881 (MEK1/2 抑制剂),适应症为家族性腺瘤性息肉病 (FAP) 及 AXIN1/APC 突变癌症。
Absci的遭遇更加典型。其TL1A项目ABS-101的1期数据显示,半衰期特征不及“下一代TL1A comparators”,导致公司被迫放弃内部推进,转向探索其他适应症和合作机会。摩根士丹利因此将ABS-101从财务模型中移除,直言此前基于炎症性肠病合作收益的假设“已不可能实现”。
第一代公司的核心困境总结

公司

市值表现

核心困境

关键原因

Recursion

股价剧烈波动,市值约29.6亿美元

管线数据不佳,被迫裁员20%、终止3个项目

过程指标无法转化为临床成功率,平台整合未带来收入增长

Schrödinger

一年下跌46%,单月再跌26%

市销率仍高达3.8倍,但投资者对软件养管线模式存疑

软件收入稳定但药物管线进展不及预期

Absci

摩根士丹利下调至Equalweight

TL1A项目数据不佳,合作预期落空

临床数据未达“下一代”标准,战略转向脱发领域增加执行风险

Relay Therapeutics

小幅反弹,接近52周高点

FDA突破性疗法认定,但尚未产生商业化收入

竞争格局变化带来预期差,但收入不确定性仍在

二、新一代公司的创新突围

与老一代形成鲜明对比,2024-2025年崛起的新一代AI制药公司呈现出截然不同的技术路径和商业模式。

Chai Discovery:从“预测”到“设计”的跨越

Chai Discovery在2025年6月发布的技术报告显示,Chai-2在针对52个多样化靶点的de novo抗体设计中,仅用≤20个抗体或纳米抗体就实现了16%的实验成功率。这一数字意味着,过去需要筛选数千个分子才能找到一个候选药物的过程,现在可能只需要测试不到20个分子。
2026年1月,Chai Discovery宣布与礼来达成合作,将部署其前沿AI平台用于设计新型生物治疗药物。这笔合作的核心是Chai-2平台——首个实现双位数实验命中率的零样本抗体设计平台,能够在数周内完成此前需要数月才能完成的发现过程。
更重要的是合作模式:Chai不仅提供核心模型访问权限,还将基于礼来的大规模专有数据训练定制AI模型,专供礼来内部使用。这意味着AI公司正在从“工具提供者”转变为“模型共建者”
Chai的团队背景同样值得关注。成员来自OpenAI、Meta FAIR、Stripe、Google X等顶尖AI公司,其B轮融资由Oak HC/FT和General Catalyst共同领投,估值达13亿美元。

Nabla Bio:哈佛孵化的“生物制剂自动补全”

作为哈佛大学的衍生公司,Nabla Bio正在开发AI平台以“自动补全”生物制剂设计过程。其核心思路是:研究人员输入所需治疗参数,平台返回优化的分子结构——这种“输入-输出”的自动化范式,试图将生物制剂开发从“手工 crafting”转向“工程设计”。

Isomorphic Labs:超越AlphaFold的药物设计引擎

2026年2月,Isomorphic Labs发布了其药物设计引擎(IsoDDE),展现出远超AlphaFold3的能力。
核心技术突破体现在三个维度:
第一,结构预测的泛化能力。在专门测试“与训练集高度不相似”体系的Runs N‘ Poses基准上,IsoDDE的准确率是AlphaFold3的两倍以上。这意味着它能够应对真正新颖的生物学空间——这正是药物发现的核心挑战。
第二,结合亲和力预测的精度革命。IsoDDE在FEP+、OpenFE和CASP16三个公开基准上远超所有深度学习方法,甚至超越了需要实验晶体结构支撑的物理学方法。首次实现了纯计算方法达到或超过传统“黄金标准”的精度
第三,隐藏口袋的识别能力。IsoDDE能够仅基于氨基酸序列,识别蛋白质上尚未被发现的“可药性口袋”。在cereblon蛋白案例中,它成功预测了2026年才被实验发现的别构隐藏口袋。这种能力将直接拓展“可成药靶点组”的边界。

Xaira Therapeutics:10亿美元豪赌“蛋白质设计革命”

Xaira的登场堪称2024年生物科技领域最具震撼性的事件。ARCH Venture Partners和Foresite Labs孵化了这家公司,并给予超过10亿美元的初始资金——这是ARCH历史上最大规模的初始投资承诺。
Xaira的核心技术来自华盛顿大学蛋白质设计研究所David Baker实验室。Baker是蛋白质设计领域的泰斗级人物,RFdiffusion和RFantibody这两个模型正是出自他的实验室。团队方面,由前Genentech首席科学官Marc Tessier-Lavigne掌舵,管理层汇集了前Genentech高管和Meta AI人才,董事会包括前强生CEO Alex Gorsky和前FDA局长Scott Gottlieb。
新一代公司的创新特点总结

公司

核心技术

关键突破

备注

Chai Discovery

Chai-2零样本抗体设计平台

双位数实验命中率,数周完成数月工作

定制模型共建,基于客户数据训练

Nabla Bio

生物制剂“自动补全”平台

输入参数、输出优化分子

自动化设计范式

Isomorphic Labs

IsoDDE药物设计引擎

结构预测泛化能力2倍于AF3,亲和力预测超越物理学方法,隐藏口袋识别

纯计算方法突破实验依赖

Xaira Therapeutics

RFdiffusion/RFantibody

蛋白质设计领域泰斗David Baker技术

10亿美元初始融资,顶尖产业与学术团队结合

三、底层逻辑的深刻变革

透过上述对比,可以看到AI制药行业正在发生的两个主要的变化。
一是从提升效率到探索未知。
第一代公司的核心逻辑是:用AI提升现有流程的效率。无论是Recursion的“数据工厂”还是Exscientia的自动化化学设计,其本质都是在加速“已知如何做”的事情。但过程指标的优化无法改变临床失败的根本概率。
新一代公司的逻辑则完全不同,用AI探索“未知的未知”。Isomorphic Labs的IsoDDE能够识别从未被实验表征过的隐藏口袋;Chai Discovery的零样本设计能够在缺乏训练数据的领域产生有效分子;David Baker的RFdiffusion能够设计自然界不存在的蛋白质结构。这不是加速现有流程,而是创造全新可能
二是从数据规模到模型智能。
老一代公司普遍强调“专有数据”的壁垒。Recursion斥资4700万美元购买Tempus数据,宣称要构建“最大专有生物数据集”。这种思路的隐含假设是:数据越多,模型越强。
但新一代公司的表现证明,模型架构和算法突破正在超越数据规模的优势。IsoDDE在训练集之外的体系上表现优于AlphaFold3,证明其泛化能力来自模型设计而非数据规模。Chai Discovery能够在零样本条件下实现双位数命中率,同样依赖模型架构的创新。这标志着竞争焦点从谁拥有更多数据,转向能设计更聪明的算法。

四、监管定调,医疗视角下的行业终局

2025年1月6日,FDA发布了《使用人工智能支持药品和生物制品监管决策的注意事项》指南草案。这是首个AI 药物开发指导原则,引入“基于风险的可信度评估框架”(Risk-based Credibility Framework)。标志着FDA对AI技术的态度从观望、接受到规范化管理的重大转变。在监管眼中,AI 不再是 “试验性工具”,而是受监管认可的手段。
虽然这是一份草案指南,尚不具备完全的法律强制力,但它系统性地提出了“基于风险的可信度评估框架”,通过7个步骤,指导企业如何为其AI模型在特定“使用环境”下的可靠性和准确性建立证据,从而支持监管决策。
当前资本和舆论对AI 技术用于新药研发的憧憬,往往受互联网行业思维定式影响。认为未来格局是少数AI 制药巨头赢者通吃,类似搜索领域的Google、手机操作系统的 iOS/安卓),甚至期待出现如同ChatGPT、Deepseek“输入指令即生成文本/ PPT” 那样,一步到位实现 “输入靶点即输出新药” 的终极平台。
但FDA 的监管思路揭示出截然不同的发展图景。AI 更可能以专业化工具集群的形式渗透新药研发链条。就像 CRO 企业通过分工细化提升研发效率那样,未来或将涌现大量聚焦特定环节的 AI 解决方案。这种“碎片式创新”而非颠覆式或垄断式创新的理念,这是医药行业的视角,而非互联网行业视角。
 
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