（一）多元筹资机制不健全，财政投入压力较大。调研发现，多地公办高校学费、住宿费标准长期未调整，与经济社会发展水平、学生培养成本变化也不匹配。
（二）优质高等教育资源不充分不均衡。一些地方近年来为完成提高毛入学率任务，新增了不少高校，但因财力有限，投入不足，办学水平不高。147所“双一流”高校主要集中在北京、上海、江苏等省市，河北、内蒙古、云南、西藏、青海、宁夏等省区仅有1所，山东、湖北、重庆、甘肃四省均没有地方高校入选。
（三）对高等职业教育和民办高等教育的支持力度不足。一些高职院校反映，校企合作呈现“院校热、企业冷”的局面。民办高校招生遇冷现象加剧，部分面临生源短缺风险。
（四）资金资产管理水平有待提高。调研发现，各地高校不同程度存在土地、房屋等固定资产低效闲置问题。部分高校存在重复、盲目购置高价设备的情况。
（五）面临学龄人口急剧变化的挑战。高等教育学龄人口面临“快升—短平—陡降”发展趋势，在校生规模预计2032年左右达峰，到2040年左右又会大幅减少。达峰前增量投入压力大。达峰后存量资源盘活利用面临挑战。
同时，《调研报告》也针对性地提出完善投入保障机制、优化高等教育资源布局、加大对职业教育和民办教育的支持和引导、加强资金资产管理等四方面的意见建议。
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