
每次设计实验都卡在测序方法选择?别慌!整理了超实用对比指南,看完实验设计不踩坑?
mRNA测序:专注编码基因的\"单箭头选手\"
✅ 建库特点:oligo(dT)磁珠靶向捕获polyA RNA
✅ 数据分析:聚焦mRNA表达差异,不涉及非编码RNA
✅ 数据规模:6 G/样本
✅ 适合场景:只想分析基因表达变化?选它性价比蕞高!
全转录组测序:一网打尽的\"全能选手\"
✅ 建库特点:rRNA去除法保留所有RNA类型
✅ 数据分析:mRNA+lncRNA+circRNA联合分析,ceRNA网络构建
✅ 数据规模:12 G/样本
✅ 适合场景:想研究RNA互作机制?这个方法蕞荃面!
Small RNA测序:小身材大作用的\"细节控\"
✅ 建库特点:精准切胶回收20-50nt小片段RNA
✅ 数据分析:miRNA定量+靶基因预测,piRNA/tRNA片段分析
✅ 数据规模:2000万reads/样本
✅ 适合场景:miRNA调控研究或标志物筛选必选
全长转录组测序:三代技术加持的\"真相帝\"
✅ 建库特点:polyA富集+PacBio/Nanopore三代测序
✅ 数据分析:直接获取全长转录本,无拼接错误
✅ 数据规模:20 G/样本
✅ 适合场景:可变剪接、新异构体发现、无参物种注释
选择小口诀
? mRNA+非编码互作 → 全转录组测序
? 只看mRNA表达 → 转录组测序
? 小RNA调控 → Small RNA测序
? 精细结构研究 → 全长转录组测序
实验设计选对方法真的太重要啦!赶紧收藏起来,下次设计实验直接套用~ ?
#RNA测序#rnaseq#转录组#转录组测序#转录组下游分析#实验设计#实验干货#欧易生物@欧易生物
mRNA测序:专注编码基因的\"单箭头选手\"
✅ 建库特点:oligo(dT)磁珠靶向捕获polyA RNA
✅ 数据分析:聚焦mRNA表达差异,不涉及非编码RNA
✅ 数据规模:6 G/样本
✅ 适合场景:只想分析基因表达变化?选它性价比蕞高!
全转录组测序:一网打尽的\"全能选手\"
✅ 建库特点:rRNA去除法保留所有RNA类型
✅ 数据分析:mRNA+lncRNA+circRNA联合分析,ceRNA网络构建
✅ 数据规模:12 G/样本
✅ 适合场景:想研究RNA互作机制?这个方法蕞荃面!
Small RNA测序:小身材大作用的\"细节控\"
✅ 建库特点:精准切胶回收20-50nt小片段RNA
✅ 数据分析:miRNA定量+靶基因预测,piRNA/tRNA片段分析
✅ 数据规模:2000万reads/样本
✅ 适合场景:miRNA调控研究或标志物筛选必选
全长转录组测序:三代技术加持的\"真相帝\"
✅ 建库特点:polyA富集+PacBio/Nanopore三代测序
✅ 数据分析:直接获取全长转录本,无拼接错误
✅ 数据规模:20 G/样本
✅ 适合场景:可变剪接、新异构体发现、无参物种注释
选择小口诀
? mRNA+非编码互作 → 全转录组测序
? 只看mRNA表达 → 转录组测序
? 小RNA调控 → Small RNA测序
? 精细结构研究 → 全长转录组测序
实验设计选对方法真的太重要啦!赶紧收藏起来,下次设计实验直接套用~ ?
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