这篇文章来自安徽医科大学团队，发表在Environmental Pollution上，研究的是双酚A（BPA，一种内分泌干扰物）与先兆子痫之间的关系以及分子机制。作者先通过人群遗传学方法确立因果关系，再利用单细胞技术定位关键细胞类型，接着通过生物信息学分析预测分子作用机制，最后在细胞模型中进行功能验证。
?设计思路
1⃣使用大型欧洲血统的全基因组关联数据进行的双样本MR分析，分析BPA 暴露与先兆子痫（PE）风险之间的关系。
2⃣分析了来自GEO的GSE265862 scRNA-seq数据，该数据集包含了来自未怀孕且有明确妊娠史（12 例有既往正常血压妊娠，11 例有严重PE，符合 ACOG 标准）的晚期分泌型子宫内膜活检样本。以识别出哪些细胞类型在 PE 病理状态下发生了异常。
3⃣整合了多个胎盘组织的bulk RNA-seq 数据集（GSE10588、GSE24129、GSE25906，GSE73374，E-TABM-682），并运用WGCNA筛选与PE相关的基于模块，随后将这些模块基因与已知的 PE 基因、BPA 靶基因以及单细胞数据中的高可变基因进行交集分析。
4⃣通过分子对接和分子动力学模拟验证BPA 与核心基因的结合情况。
5⃣在人类 HTR-8/SVneo 胎盘细胞中进行功能实验验证。
1）通过WB检测STAT3 的磷酸化水平
2）通过Co-IP检测IL-6 与 STAT3 的相互作用
3）qRT-PCR检测下游靶基因(SOCS3, MMP9, IL-8)的表达变化#生信分析 #实证分析 #提供思路和创新点#机器学习#数据分析#研究思路#研究热点
?设计思路
1⃣使用大型欧洲血统的全基因组关联数据进行的双样本MR分析，分析BPA 暴露与先兆子痫（PE）风险之间的关系。
2⃣分析了来自GEO的GSE265862 scRNA-seq数据，该数据集包含了来自未怀孕且有明确妊娠史（12 例有既往正常血压妊娠，11 例有严重PE，符合 ACOG 标准）的晚期分泌型子宫内膜活检样本。以识别出哪些细胞类型在 PE 病理状态下发生了异常。
3⃣整合了多个胎盘组织的bulk RNA-seq 数据集（GSE10588、GSE24129、GSE25906，GSE73374，E-TABM-682），并运用WGCNA筛选与PE相关的基于模块，随后将这些模块基因与已知的 PE 基因、BPA 靶基因以及单细胞数据中的高可变基因进行交集分析。
4⃣通过分子对接和分子动力学模拟验证BPA 与核心基因的结合情况。
5⃣在人类 HTR-8/SVneo 胎盘细胞中进行功能实验验证。
1）通过WB检测STAT3 的磷酸化水平
2）通过Co-IP检测IL-6 与 STAT3 的相互作用
3）qRT-PCR检测下游靶基因(SOCS3, MMP9, IL-8)的表达变化#生信分析 #实证分析 #提供思路和创新点#机器学习#数据分析#研究思路#研究热点
