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生信分析分析

   日期:2025-11-03 10:04:09     来源:网络整理    作者:本站编辑    评论:0    
生信分析分析

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生信sci一区二区三区四区
分析数据库:TCGA,ICGC,TCPA,GDSC,GTEx,CPTAC,CGGA,GEO,Target,ArrayExpress,METABRIC,exoRBase等
分析方向:mRNA、miRNA、lncRNA、ceRNA网络、蛋白组学、甲基化、预后模型方向、单基因方向、泛癌方向、分子分型、多数据库联合分析、单细胞测序等
分析内容:差异表达、生存预后、肿瘤微环境、免疫浸润、突变landscape、拷贝数变异、免疫治疗及化疗敏感性等
分析算法:随机森林、SVM、lasso、meta、WGCNA、共识聚类、非负矩阵分解、cox模型内部验证/外部验证、GSVA、ssGSEA等
分析套路:糖酵解、代谢、自噬、免疫/免疫基因pair、lncRNA pair、甲基化驱动、免疫分型、细胞焦亡、肿瘤干性、基因组不稳定性、单基因meta、增强子eRNA、可变剪
转录组数据分析代做 多组学联合分析,包括代谢组、转录组、16S、宏基因组等。支持chip-seq、hic等高级分析,生信分析一站式到位!
转录组分析详情:
- RNA-seq:从原始测序到差异表达分析,包含质量评估、比对、基因定量、差异分析及可视化。
- circRNA-seq
- chip-seq:从原始文件到motif
- ATAC-seq、Hi-C等
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